More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1032 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  100 
 
 		 102 aa  204  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  93.88 
 
 		 98 aa  187  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  90.53 
 
 		 96 aa  177  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  45.78 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  57.53 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  49.32 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 94 aa  73.6  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  37.8 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  42.17 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  44.3 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1369  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  37.18 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  33.68 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  30.49 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  32.47 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  36.36 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  42.65 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>