More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0179 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 87 aa  178  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  59.52 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  52.87 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  58.75 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  52.87 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  51.72 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  53.16 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 99 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  47.62 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  51.35 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  53.12 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  39.02 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  33.73 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  41.33 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  41.33 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  39.19 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  36.25 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  33.73 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  35 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 317 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  33.73 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  35.9 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  34.62 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  37.84 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.46 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>