More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1060 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  90.53 
 
 
102 aa  177  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  88.42 
 
 
98 aa  172  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
87 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 
99 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
85 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  44.58 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
93 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  57.53 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
94 aa  73.6  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  37.8 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  44.3 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  44.3 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  38.16 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  37.18 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  32.26 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  32.56 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  32.56 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
317 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  43.55 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  36.11 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  31.71 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  32.93 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  31.76 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  30.61 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  36.84 
 
 
113 aa  57.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
121 aa  57  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  30.26 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 
106 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1369  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  32.91 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>