More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0329 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
88 aa  181  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 
94 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  56.04 
 
 
93 aa  103  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  54.12 
 
 
91 aa  101  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
87 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
96 aa  87  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
114 aa  84.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
94 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
98 aa  76.6  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  47.62 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  36.05 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  42.31 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  33.73 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0211  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  32.93 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  33.73 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  32.53 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  30.86 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  36.05 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  31.71 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  27.16 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
111 aa  53.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
106 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
103 aa  53.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  39.74 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  30.86 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  32.91 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  30.86 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  34.25 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 
120 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  30.59 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  30 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 
106 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
197 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  29.27 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  32.88 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  28.05 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  30.86 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  34.85 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
114 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>