More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1989 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
125 aa  258  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 
94 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  57.73 
 
 
103 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  59.34 
 
 
96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  58.89 
 
 
90 aa  119  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  58.89 
 
 
90 aa  120  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  58.89 
 
 
90 aa  119  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  57.78 
 
 
90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  60.98 
 
 
114 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  56.67 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  58.62 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  55.79 
 
 
97 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  54 
 
 
103 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 
87 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 
85 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  51.22 
 
 
99 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  48.75 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  54.12 
 
 
100 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  47.5 
 
 
102 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
94 aa  89  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 
96 aa  87.4  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  43.9 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  45.33 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  41.46 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  50 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  43.84 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  31.31 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  44.44 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  42.68 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1825  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
115 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  43.04 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1860  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  32.14 
 
 
113 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
114 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  38.64 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 
114 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 
183 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>