More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2973 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
94 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  67.42 
 
 
96 aa  135  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  68.97 
 
 
90 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  68.97 
 
 
90 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  68.97 
 
 
90 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  68.97 
 
 
90 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  67.82 
 
 
90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  67.06 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 
125 aa  122  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  60.92 
 
 
97 aa  114  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  61.18 
 
 
89 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  52.87 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  55.29 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  58.54 
 
 
99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
93 aa  88.6  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 
89 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  44.05 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
88 aa  84  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
96 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.25 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  45 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  42.68 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  41.11 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  39.53 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  41.03 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  39.74 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  33.67 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  40 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  37.18 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  34.07 
 
 
109 aa  66.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  38.75 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  38.75 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>