More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1247 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 98 aa  196  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  93.88 
 
 		 102 aa  187  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  88.42 
 
 		 96 aa  172  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  48.75 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 87 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 99 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  46.99 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  58.9 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  47.56 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 88 aa  76.6  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  49.32 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  39.02 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  38.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  34.41 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  44.3 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  44.3 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  37.18 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1369  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  35.37 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  31.94 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  42.65 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  33.77 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  32.5 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  38.57 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  35.53 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>