More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1697 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  51.22 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 96 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  32.93 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  40.28 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  46.27 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  39.74 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  34.15 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  32.53 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  34.67 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  36.71 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  35.53 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  31.76 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  32 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.33 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 307 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>