More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2628 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 339 aa  161  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  33.53 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  36.49 
 
 		 155 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  91.3  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  41.86 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  28.74 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4191  hypothetical protein  40.7 
 
 		 101 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1162  hypothetical protein  41.86 
 
 		 101 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  40.7 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0999  hypothetical protein  40.7 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  40.7 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1011  hypothetical protein  40.7 
 
 		 106 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 106 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1083  hypothetical protein  40.7 
 
 		 106 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1240  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 100 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  29.57 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  39.47 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  37.5 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  31.25 
 
 		 96 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 429 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  33.77 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 110 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  41.79 
 
 		 254 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  41.79 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 119 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  35.82 
 
 		 110 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 120 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 121 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 120 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  35.62 
 
 		 131 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 95 aa  52.8  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 127 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 96 aa  52.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 124 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 106 aa  52.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 124 aa  52  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 120 aa  52  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 124 aa  52  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  40.3 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  40.3 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  40.3 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  40.3 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 125 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  28.7 
 
 		 113 aa  51.6  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 93 aa  51.6  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 134 aa  51.2  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 117 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 103 aa  51.2  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  40.3 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  40.3 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  40.3 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  40.3 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02330  uncharacterized conserved protein (DUF2087)  36.25 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 113 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  28.57 
 
 		 123 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 123 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 113 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  32.58 
 
 		 97 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  27.78 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 85 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 119 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  28.57 
 
 		 113 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 95 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 110 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  35.62 
 
 		 79 aa  49.3  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 310 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 108 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 		 95 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 113 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 102 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  32.91 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  27.43 
 
 		 342 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 89 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 105 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  36.76 
 
 		 129 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 		 120 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 95 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  36.76 
 
 		 129 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 98 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 90 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 90 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 107 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 90 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  32.89 
 
 		 121 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>