More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3178 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 129 aa  255  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 129 aa  255  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  85.5 
 
 		 134 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  80.3 
 
 		 135 aa  204  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  78.36 
 
 		 136 aa  202  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  75.86 
 
 		 138 aa  175  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  78.26 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  80.73 
 
 		 127 aa  173  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  73.28 
 
 		 128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  80.39 
 
 		 118 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  80.39 
 
 		 118 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 124 aa  163  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 124 aa  163  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 124 aa  163  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  82.91 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  74.04 
 
 		 120 aa  151  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  75 
 
 		 127 aa  150  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  81.37 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  73.96 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  77.97 
 
 		 125 aa  146  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  77.97 
 
 		 125 aa  146  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  77.97 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  73.47 
 
 		 113 aa  140  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  64.04 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  66.06 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  65.71 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  63.06 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  65.09 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  68.37 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  71.62 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  59.38 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  54.84 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  61.86 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  45.38 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5331  putative transcriptional regulator  58.62 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0697124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5679  putative transcriptional regulator  58.62 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455024 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  35.92 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  41.24 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  44.29 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  34.48 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  43.75 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  31.52 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  33.75 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  32.67 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  43.42 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  29.89 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  41.77 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>