49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3346 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  61.63 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  59.09 
 
 		 178 aa  102  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  57.3 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  51.14 
 
 		 309 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  47.13 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 216 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  50.63 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  41.46 
 
 		 254 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  41.46 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  41.46 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  41.46 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  41.46 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  41.46 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  40.24 
 
 		 254 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  40.24 
 
 		 254 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  44.29 
 
 		 254 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  42.86 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  34.15 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  39.02 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  34.67 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4191  hypothetical protein  32.93 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0999  hypothetical protein  32.93 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1240  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1083  hypothetical protein  32.93 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1011  hypothetical protein  32.93 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  34.52 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1162  hypothetical protein  32.93 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  43.08 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  36.62 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  36.47 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 429 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00374  hypothetical protein  40.74 
 
 		 407 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1246  hypothetical protein  54 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.898285 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1213  hypothetical protein  36.78 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230618  normal  0.579849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  34.52 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4988  hypothetical protein  37.04 
 
 		 412 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  36.9 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  31.4 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0891  hypothetical protein  37.74 
 
 		 412 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.571555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0199  hypothetical protein  36.62 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0964  Protein of unknown function DUF2087  35.21 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.580325  hitchhiker  0.0000920337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>