26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1246 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1246  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  231  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.898285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  43.59 
 
 
165 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  34.18 
 
 
251 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  48.89 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 
309 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  37.04 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  42.11 
 
 
254 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  42.11 
 
 
254 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  42.11 
 
 
254 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  40.35 
 
 
254 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  40.35 
 
 
254 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  40.35 
 
 
254 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  40.35 
 
 
254 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  54 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  35.23 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  39.29 
 
 
254 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  38.6 
 
 
254 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  38.6 
 
 
254 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  40.35 
 
 
254 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 
339 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  38.89 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 
188 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  38.89 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0964  Protein of unknown function DUF2087  40.54 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.580325  hitchhiker  0.0000920337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>