56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0055 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  150  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
429 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  34.18 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
188 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  48.48 
 
 
254 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
216 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  40.28 
 
 
171 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  43.94 
 
 
254 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  43.94 
 
 
254 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  43.94 
 
 
254 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  43.94 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  43.94 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  43.94 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  43.94 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  43.94 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  42.42 
 
 
254 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  39.51 
 
 
251 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  40.62 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  42.42 
 
 
254 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1246  hypothetical protein  48.89 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.898285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  36.62 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  40.62 
 
 
184 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
196 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  40.28 
 
 
101 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  42.03 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  32.86 
 
 
339 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  30.56 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  30.99 
 
 
181 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  29.17 
 
 
96 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  40.28 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0999  hypothetical protein  39.73 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  40.28 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1162  hypothetical protein  38.89 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1011  hypothetical protein  38.89 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
309 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1083  hypothetical protein  38.89 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1240  transcriptional regulator  38.89 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4191  hypothetical protein  38.57 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  32.39 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  26.25 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  38.89 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  34.29 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  27.16 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  32.35 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0891  hypothetical protein  42.11 
 
 
412 aa  46.2  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.571555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  28.4 
 
 
190 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  28.17 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  30.99 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00374  hypothetical protein  43.75 
 
 
407 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  27.78 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0199  hypothetical protein  28.77 
 
 
167 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>