More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2803 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  41.99 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  42.21 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  31.82 
 
 		 339 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  33.16 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  49.37 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  51.25 
 
 		 89 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  31.18 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  47.3 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 106 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  39.19 
 
 		 100 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1011  hypothetical protein  37.33 
 
 		 106 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4191  hypothetical protein  37.33 
 
 		 101 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1083  hypothetical protein  37.33 
 
 		 106 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  42.11 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1162  hypothetical protein  37.33 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  35.44 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0999  hypothetical protein  36 
 
 		 100 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  44.74 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  44.74 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  44.74 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1240  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 100 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  42.11 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  43.42 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  43.42 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  43.42 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  43.42 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  43.06 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  40.79 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0755  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.554367  normal  0.0268545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 100 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 100 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 144 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 127 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 125 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  45.83 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  34.02 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  37.18 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 119 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  45.71 
 
 		 112 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  30.95 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 109 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  34.44 
 
 		 119 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 121 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 111 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 122 aa  53.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1206  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 115 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 102 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 119 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  33.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 116 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  33.33 
 
 		 119 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  32.71 
 
 		 133 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 120 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 113 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  32.32 
 
 		 136 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 125 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 111 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  36.14 
 
 		 105 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2186  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 105 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000631011  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 106 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 124 aa  51.6  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 117 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  43.21 
 
 		 120 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  36.71 
 
 		 96 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 112 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  31.31 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  31.78 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  31.78 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  41.54 
 
 		 103 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 122 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  40.85 
 
 		 117 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 109 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  42.19 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  32.93 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 109 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 113 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 113 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  29.51 
 
 		 123 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 		 112 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 113 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 98 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 115 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>