57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0453 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  35.95 
 
 		 155 aa  104  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  37.65 
 
 		 171 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  47.13 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  37.28 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  43.53 
 
 		 254 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  43.53 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  43.53 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  43.53 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  43.53 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  43.53 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  42.22 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  42.35 
 
 		 254 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 254 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  41.18 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  41.18 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  38.82 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 309 aa  67.8  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  35.23 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  28.8 
 
 		 339 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  32.71 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0999  hypothetical protein  26.74 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1011  hypothetical protein  26.74 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1083  hypothetical protein  26.74 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  53.06 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1162  hypothetical protein  26.74 
 
 		 101 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  27.63 
 
 		 100 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  26.74 
 
 		 101 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  33.71 
 
 		 96 aa  52.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1240  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 100 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  40.45 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4191  hypothetical protein  25.58 
 
 		 101 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00374  hypothetical protein  44 
 
 		 407 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  29 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  36.25 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  32.11 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1246  hypothetical protein  35.23 
 
 		 114 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.898285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4988  hypothetical protein  40.82 
 
 		 412 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  35.05 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  35.05 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  31.63 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  34.29 
 
 		 79 aa  45.8  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  32.35 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  29.89 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  29.79 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  31.11 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2232  hypothetical protein  31.11 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  30.17 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.328088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>