23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1971 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  349  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  97.75 
 
 		 178 aa  343  7e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  55.68 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  57.95 
 
 		 181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  54.24 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  55.37 
 
 		 182 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  55.31 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  48.82 
 
 		 234 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  47.09 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  42.7 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  43.48 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  36.75 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  35.15 
 
 		 184 aa  103  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  34.55 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  32.16 
 
 		 180 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  36.71 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  30.53 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 429 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  33.82 
 
 		 251 aa  48.5  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  35.05 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 309 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 106 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>