28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1129 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  356  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  41.44 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  42.31 
 
 		 182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  41.1 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  39.23 
 
 		 181 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  43.48 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  43.48 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  38.76 
 
 		 190 aa  120  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  39.18 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  34.97 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  34.57 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  34.59 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  33.91 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  34.78 
 
 		 234 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  33.74 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  29 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  33.85 
 
 		 107 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  30.23 
 
 		 251 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  33.85 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  33.85 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  33.85 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  32.31 
 
 		 254 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  32.31 
 
 		 254 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  32.31 
 
 		 254 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  32.31 
 
 		 254 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  33.85 
 
 		 254 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  33.85 
 
 		 254 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  40.8  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>