25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2321 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  48.11 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  49.07 
 
 		 190 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  46.78 
 
 		 199 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  48.82 
 
 		 181 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  49.76 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  48.82 
 
 		 178 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  45.97 
 
 		 182 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  42.79 
 
 		 174 aa  138  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  42.31 
 
 		 168 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  36.02 
 
 		 172 aa  95.9  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  31.22 
 
 		 171 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  29.67 
 
 		 171 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  30.2 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  25.7 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 107 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  31.17 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  28.05 
 
 		 254 aa  42  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>