31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3387 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  84.12 
 
 		 171 aa  296  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  58.05 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  59.41 
 
 		 171 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  41.32 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  38.82 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  36.09 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  33.94 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  36.97 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  35.15 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  36.75 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  35.15 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  34.97 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  32.93 
 
 		 168 aa  85.5  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  28.22 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  34.12 
 
 		 107 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  40.62 
 
 		 79 aa  54.3  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 429 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  35.23 
 
 		 96 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  34.15 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 339 aa  48.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  32.03 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  31.63 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  36.36 
 
 		 254 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  31.4 
 
 		 89 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  34.85 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  34.85 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  34.85 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  34.85 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 309 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 196 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>