47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6202 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  339  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  61.63 
 
 
89 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  45.66 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  47.25 
 
 
96 aa  91.3  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 
309 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  40.14 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  37.65 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  45.78 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  49.3 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  33.01 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  35.71 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1083  hypothetical protein  35.06 
 
 
106 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  35.06 
 
 
106 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  35.06 
 
 
101 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1011  hypothetical protein  35.06 
 
 
106 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  41.67 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1162  hypothetical protein  35.06 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1240  transcriptional regulator  35.06 
 
 
100 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0999  hypothetical protein  33.78 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  35.82 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  40.28 
 
 
79 aa  60.5  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  38.03 
 
 
254 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  32.97 
 
 
254 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  32.97 
 
 
254 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  32.97 
 
 
254 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4191  hypothetical protein  32.43 
 
 
101 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  32.97 
 
 
254 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  32.97 
 
 
254 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  36.62 
 
 
254 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  45.95 
 
 
148 aa  57.4  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00374  hypothetical protein  45.9 
 
 
407 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  31.87 
 
 
254 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  31.87 
 
 
254 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  31.87 
 
 
254 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  36.62 
 
 
254 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
429 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1246  hypothetical protein  37.04 
 
 
114 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.898285 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  35.23 
 
 
96 aa  50.8  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4988  hypothetical protein  40.98 
 
 
412 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0891  hypothetical protein  43.4 
 
 
412 aa  46.6  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.571555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1213  hypothetical protein  34.09 
 
 
104 aa  44.7  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230618  normal  0.579849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  35.14 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  34.78 
 
 
181 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  33.8 
 
 
199 aa  41.2  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>