44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3787 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  100 
 
 		 96 aa  189  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  57.3 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  47.25 
 
 		 171 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  45.78 
 
 		 178 aa  80.1  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  54.05 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  48.05 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  42.22 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  47.95 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 196 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  31.82 
 
 		 254 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  31.82 
 
 		 254 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  31.82 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  31.82 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  31.82 
 
 		 254 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  31.82 
 
 		 254 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 		 339 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  31.82 
 
 		 254 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 254 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  31.11 
 
 		 251 aa  57  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  39.19 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  47.62 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  29.17 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 429 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1011  hypothetical protein  27.47 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1083  hypothetical protein  27.47 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  29.07 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  28.57 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1213  hypothetical protein  43.84 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230618  normal  0.579849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0999  hypothetical protein  26.74 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1162  hypothetical protein  27.91 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1240  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4191  hypothetical protein  27.47 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1246  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.898285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0891  hypothetical protein  39.62 
 
 		 412 aa  43.9  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.571555  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00374  hypothetical protein  36 
 
 		 407 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4988  hypothetical protein  36 
 
 		 412 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>