50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4198 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  100 
 
 		 178 aa  343  8e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  45.66 
 
 		 171 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  38.51 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  59.09 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  33.9 
 
 		 339 aa  91.3  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  37.87 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  43.01 
 
 		 96 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  36.94 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  49.37 
 
 		 309 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  44.29 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  40.7 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  39.53 
 
 		 254 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  36.36 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  35.23 
 
 		 254 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1083  hypothetical protein  34.57 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  42.86 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1011  hypothetical protein  34.57 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  38.37 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  38.37 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  38.37 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0891  hypothetical protein  25.73 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.571555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1162  hypothetical protein  34.57 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  38.37 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  34.88 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1240  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0999  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  38.57 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4191  hypothetical protein  30.67 
 
 		 101 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4988  hypothetical protein  29.76 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  30.56 
 
 		 79 aa  53.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00374  hypothetical protein  26.9 
 
 		 407 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  40.51 
 
 		 96 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  28.77 
 
 		 251 aa  48.5  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0834  hypothetical protein  37.8 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1246  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.898285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  34.12 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  36.36 
 
 		 178 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  36.36 
 
 		 178 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  34.74 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>