22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0834 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0834  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  348  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  35.2 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 94 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  36.59 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  27.84 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 97 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 		 99 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 		 92 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  37.88 
 
 		 99 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  31.58 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  37.88 
 
 		 99 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  28.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  38.57 
 
 		 182 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  33.8 
 
 		 254 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  35.21 
 
 		 254 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  33.8 
 
 		 254 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  35.21 
 
 		 254 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>