More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0892 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  233  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  79.46 
 
 		 112 aa  187  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  79.28 
 
 		 112 aa  187  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  38.74 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1264  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00305286  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  39 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  44.78 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  50.75 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  48.57 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  41.18 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  41.51 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0459  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 307 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 311 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  46.15 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 324 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  34.82 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  38.46 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  38.46 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  46.88 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  46.58 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  48.39 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  46.58 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 328 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.14 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  48.44 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.14 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 307 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  40.78 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  41.58 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 312 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  42.03 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 305 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>