More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3375 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  61.4 
 
 
131 aa  144  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  68 
 
 
127 aa  136  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  64.58 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 
127 aa  131  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  59.81 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  56.44 
 
 
125 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 
116 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  58.76 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  60.42 
 
 
127 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  57 
 
 
116 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  51.67 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  56.6 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  71.08 
 
 
125 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  69.88 
 
 
125 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 
124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  65.43 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  57.94 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  50.43 
 
 
125 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  49.59 
 
 
121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  57.29 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  50 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  59.77 
 
 
95 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  57.61 
 
 
120 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  52 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  49.11 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  48.74 
 
 
137 aa  108  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  66.67 
 
 
120 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  59.3 
 
 
109 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  51.96 
 
 
122 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
123 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
125 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
125 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
125 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
127 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
120 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  58.02 
 
 
183 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.67 
 
 
105 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 
112 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  45.22 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  48.48 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 
337 aa  94.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  75.93 
 
 
68 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  50.6 
 
 
336 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 
347 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 
337 aa  89.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 
349 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 
116 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  51.25 
 
 
108 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  41.75 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  44.83 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  41.94 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 
101 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  38.82 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  38.82 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  38.82 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  40.51 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  40.51 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  40.51 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  37.65 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  38.82 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  33.7 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  37.33 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  44.32 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  47.56 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  37.33 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
115 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  43.04 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  43.68 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  42.39 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  35.06 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>