More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
116 aa  235  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  55.86 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 
129 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  59.22 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  55.14 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  54.9 
 
 
127 aa  124  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  57.58 
 
 
127 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  57 
 
 
116 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  59.14 
 
 
120 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  64.37 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  68.29 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  63.53 
 
 
116 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  48.25 
 
 
136 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  54.12 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  56.67 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  56.67 
 
 
125 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  58.14 
 
 
123 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 
115 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  51.49 
 
 
119 aa  106  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  54.17 
 
 
125 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
124 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  47.12 
 
 
126 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
125 aa  103  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  48.62 
 
 
127 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 
124 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
137 aa  102  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 
121 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 
112 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
118 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.49 
 
 
113 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
126 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  50.51 
 
 
122 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  59.49 
 
 
183 aa  100  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  56.1 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 
120 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  58.02 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  54.76 
 
 
123 aa  95.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  52.33 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  60.27 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  58.9 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  53.49 
 
 
116 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  52.7 
 
 
104 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  74 
 
 
68 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  56.06 
 
 
349 aa  85.9  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  43.75 
 
 
336 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  55.38 
 
 
347 aa  84.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  48.81 
 
 
337 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  42.11 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  54.17 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  40.79 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  42.47 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  42.11 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  42.35 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  42.86 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  42.35 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  54.55 
 
 
306 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  46.67 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  43.28 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>