More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2335 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  94.78 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  67.54 
 
 		 114 aa  169  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 114 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 114 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  64.04 
 
 		 114 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  64.91 
 
 		 114 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  64.91 
 
 		 114 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  64.91 
 
 		 114 aa  160  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 115 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  59.13 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  57.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  55.65 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  50.43 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  52.63 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 275 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  52.17 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  50.88 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  53.1 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 258 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.83 
 
 		 305 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  50 
 
 		 111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.37 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  53.51 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  47.52 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  57.47 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  58.62 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  48.11 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.15 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 114 aa  110  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  54.12 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.76 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.76 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.76 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  44.14 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  44.14 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.14 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.14 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  44.14 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.14 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.24 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.24 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.62 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  47.78 
 
 		 248 aa  90.1  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  48.72 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  54.05 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  45.37 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  53.62 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  41 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0487  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 		 309 aa  68.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0315  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  44.29 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  52.24 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2952  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  47.76 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 328 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>