More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0567 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 126 aa  260  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  41.94 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1264  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00305286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  47.95 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  43.66 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  37.35 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  39.47 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  29.84 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 258 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  39.47 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  40.79 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  33.94 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  39.47 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  37.88 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  37.88 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  34.74 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  31.3 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  37.84 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  34.15 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 348 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  36.49 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 307 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.84 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.84 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.84 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0706  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  30.47 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  43.55 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>