More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1821 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
121 aa  244  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  58.18 
 
 
120 aa  133  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  56.64 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  54.7 
 
 
122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  54.31 
 
 
123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  55.75 
 
 
122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  53.1 
 
 
122 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  55.17 
 
 
124 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  47.37 
 
 
123 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  47.41 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
117 aa  97.1  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  41.59 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  41.96 
 
 
124 aa  94.4  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  41.96 
 
 
124 aa  94.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  41.44 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  40.5 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  43.22 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  43.22 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
125 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
125 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
124 aa  91.3  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  44.35 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  42.98 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
132 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  43.86 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  38.84 
 
 
124 aa  87  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
121 aa  87  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  40.18 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  41.74 
 
 
119 aa  84.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  35.34 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  33.62 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 
120 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
120 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  37.39 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.65 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  34.82 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  45.24 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  41.74 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  44.05 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  39.82 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1791  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  33.88 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  34.69 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  39.56 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2222  transcriptional regulator CadC  31.53 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.550657  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  35.09 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>