More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 120 aa  239  9e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  61.06 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  55.74 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  63.73 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  56.64 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  61.86 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1791  transcriptional regulator, ArsR family  61.11 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0907  regulatory protein, ArsR  62.89 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  45.36 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  43.14 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  39.39 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  38.78 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  46.91 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  45.68 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.67 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  38.3 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  40.43 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  48.48 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  48.81 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  50.7 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  44.19 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1719  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  48 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>