More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3682 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
127 aa  253  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  94.49 
 
 
127 aa  228  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  94.49 
 
 
127 aa  228  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  83.46 
 
 
127 aa  207  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  76.19 
 
 
127 aa  187  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0907  regulatory protein, ArsR  83.59 
 
 
128 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  67.83 
 
 
128 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  60.68 
 
 
121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  55.74 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1791  transcriptional regulator, ArsR family  62.14 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  36.54 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  43.21 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  42.17 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  36.63 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  39.8 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  32.29 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  32.29 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  33 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  37.37 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  29.91 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
115 aa  62.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
174 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
116 aa  58.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  43.42 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  42.03 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
123 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 
113 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
120 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1812  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122614  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  33.7 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>