More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2845 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
127 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  47.37 
 
 
119 aa  104  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
124 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
121 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  47.75 
 
 
119 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  48.21 
 
 
120 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
123 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  39.09 
 
 
119 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  40.54 
 
 
121 aa  97.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  42.61 
 
 
118 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  40.37 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  45.13 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  50.49 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  39.06 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  42.59 
 
 
124 aa  94  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  42.59 
 
 
124 aa  94  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
125 aa  93.2  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
125 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  38.28 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  54.32 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  38.89 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
124 aa  90.5  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  41.8 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  39.34 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
127 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.53 
 
 
119 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  44.35 
 
 
119 aa  87.8  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.96 
 
 
119 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  41.32 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
117 aa  87  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  42.48 
 
 
173 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  34.82 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  38.79 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  40.78 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  36.61 
 
 
122 aa  84  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  41.44 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  42.61 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  38.84 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.84 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1791  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  33.93 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  40.54 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1812  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122614  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  39 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  33.75 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  30.33 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  40.62 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
317 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>