More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3096 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 121 aa  235  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  68.7 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  60.68 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  62.83 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  60.68 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  60.68 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  63.73 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0907  regulatory protein, ArsR  61.95 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1791  transcriptional regulator, ArsR family  60.91 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  43.86 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  44.44 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  33.62 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  43.21 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  36.07 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  39.6 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  33.67 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  31.68 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  58.21 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  36.17 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  34.02 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  37.11 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  40.59 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  35 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  44.74 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3444  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1812  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  41.33 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3443  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>