More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3443 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3443  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 133 aa  257  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3444  transcriptional regulator, ArsR family  80.77 
 
 		 132 aa  206  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0667  putative transcriptional regulator, ArsR family  66.12 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  52.8 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1812  transcriptional regulator, ArsR family  50.79 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1245  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.331226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  41.54 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  33.77 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  37.21 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 317 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2405  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.673414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  36.76 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  36.36 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1708  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00199719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  37.68 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  27.71 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  31.4 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  32.74 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  33.8 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  27.71 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  31.68 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 348 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  35.94 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  34.12 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  32.53 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  34.85 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>