More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1708 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1708  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00199719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1729  ArsR family transcriptional regulator  79 
 
 		 104 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 123 aa  66.6  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  40.45 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  39.77 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  35.96 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  33.68 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  34.07 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  37.5 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  32.95 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  34 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  34.83 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  32.61 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  29.89 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  36.46 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  26.6 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  28.74 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  32.71 
 
 		 123 aa  52  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  28.24 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3443  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  32.58 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  31.11 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  30.85 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1245  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.331226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0755  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.554367  normal  0.0268545 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  28.09 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  26.8 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  29.79 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  35.11 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  29.79 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  29.79 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  29.79 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>