More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1108 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  254  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  51.9 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  43.02 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  43.02 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  40.23 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  49.3 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  41.98 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  48.48 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  31.19 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  43.59 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  39.74 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  45.07 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  45.07 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  40.96 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  47.76 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  46.97 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  40.28 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>