More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1770 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  253  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  56.41 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  48.39 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  46.32 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  43.4 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  42.55 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  47.3 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  41.44 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  37.18 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  32.93 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0487  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  37.84 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  37.84 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  36.14 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  27.52 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  45.31 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  34.07 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  31.73 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  33.33 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  40.26 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  41.56 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.21 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.21 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  44.93 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  32.97 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>