More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1667 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  88.89 
 
 
117 aa  201  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  78.43 
 
 
126 aa  156  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  71.56 
 
 
134 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  70.37 
 
 
136 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  72.38 
 
 
135 aa  140  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  65.74 
 
 
130 aa  140  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  65.49 
 
 
124 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  65.49 
 
 
124 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  65.49 
 
 
124 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  61.21 
 
 
119 aa  140  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  68.22 
 
 
120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  61.61 
 
 
128 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  67.89 
 
 
138 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  71.57 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  71.57 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  71.29 
 
 
129 aa  133  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  70.83 
 
 
113 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  67 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  71.72 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  66 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  68.22 
 
 
129 aa  123  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  68.22 
 
 
129 aa  123  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 
143 aa  114  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  65.14 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  62.38 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  62.73 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  62.73 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  62.73 
 
 
145 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  56.03 
 
 
121 aa  107  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  60.22 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  60.82 
 
 
134 aa  103  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  65.06 
 
 
94 aa  100  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  62.5 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  58.02 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  37.74 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  32.69 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  37.96 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  43.06 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.33 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  44.44 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.44 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38.3 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  43.53 
 
 
120 aa  59.3  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  50 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  35.11 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  40.51 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  38.27 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  47.83 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 
119 aa  58.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
94 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.27 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 
119 aa  57.8  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
102 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
226 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>