More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3817 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
101 aa  200  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  89.11 
 
 
103 aa  178  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  74.07 
 
 
84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  68.6 
 
 
139 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  65.17 
 
 
135 aa  122  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  64.13 
 
 
120 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  64.13 
 
 
120 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  64.13 
 
 
120 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  61.46 
 
 
124 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  64.77 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  63.44 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  63.33 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  42.35 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  49.37 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  44.44 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  48 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  36.9 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  36.9 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  40 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  43.21 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  40.45 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  32.1 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  41.57 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  42.25 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  43.06 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  34.38 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  44.78 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
93 aa  60.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  40.74 
 
 
227 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>