More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4069 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 115 aa  240  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  63.72 
 
 		 119 aa  156  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  41.77 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  34.34 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  46.38 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  47.83 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  41.77 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  45.31 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  40.24 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  44.05 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  39.33 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  36 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  40.26 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  39.19 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  40.58 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  40.26 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  40.28 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 226 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>