More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3149 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  66.06 
 
 		 109 aa  153  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  60.91 
 
 		 110 aa  141  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  59.26 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  55.96 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  50.46 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  61.9 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  60.71 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  60.71 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  44.94 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  37.97 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 103 aa  66.6  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  44.3 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  35.87 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  41.56 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3450  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  49.21 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  44.78 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  33.77 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  39.33 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  38.81 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  39.53 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  42.19 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  42.19 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0051  transcriptional repressor  39.78 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  36 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  36 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  31.68 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>