More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1634 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 121 aa  244  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  51.81 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  49.43 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  44.12 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 110 aa  83.6  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  46.43 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  43.68 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  45.12 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  42.17 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  41.76 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  41.76 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  41.18 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  40.96 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  42.68 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  42.68 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  42.17 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  39.18 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  36.25 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3418  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00835555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2752  transcriptional regulator, TrmB  37.66 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3741  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2815  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  35.92 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>