More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2308 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  222  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  63 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  54.81 
 
 		 110 aa  120  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  58.51 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  50.47 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  55.67 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  54.74 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  54.74 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  50.48 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 125 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  48.54 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  52.69 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  44.76 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 116 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  47.78 
 
 		 227 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  45.28 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  44.23 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  45 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  44.21 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  49.33 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  44.68 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  40.78 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  43.62 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  44.09 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  42.55 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  42.55 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  46.94 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  37.76 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.18 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  36.96 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  46.75 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  41.86 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  46.81 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  38.14 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>