More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0357 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 103 aa  207  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  75 
 
 		 105 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  52.69 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  50.49 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 96 aa  105  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  57.83 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  48.51 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 113 aa  97.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  44.12 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  44.09 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  45.16 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  40.59 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  41.75 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  40.62 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  41.3 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  39 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  45.26 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  45.16 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  37.25 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  45.45 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  38.83 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  46.75 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  39.18 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.31 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  41.3 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0944  ArsR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  41.86 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.58 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  41.3 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>