More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1306 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  220  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  78.67 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  50.48 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  55.21 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  56.04 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  51.96 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  52.63 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  48.54 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  49.48 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  48.45 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  49.48 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 127 aa  97.1  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  52.69 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  50.54 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  46.6 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  48.45 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  46.94 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  48.45 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  52.38 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  47 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  47.42 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.39 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  40.59 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 101 aa  90.1  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  46.39 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  41.58 
 
 		 102 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 102 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 102 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  51 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 		 102 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  42.57 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  46.39 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  46.39 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  50 
 
 		 87 aa  87  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  48.91 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  46.81 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.58 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  42 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>