More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4302 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  210  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  79.25 
 
 		 106 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  88.04 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  75.47 
 
 		 113 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  79.38 
 
 		 104 aa  157  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  63.74 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  60.64 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  51.09 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  51.61 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  52.33 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  48.45 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  57.14 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  50 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  48.91 
 
 		 98 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  49.45 
 
 		 107 aa  93.2  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  50 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  52.13 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  48.24 
 
 		 85 aa  90.9  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  51.69 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  48.91 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  50 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  49.45 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  46.94 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  52.27 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  47.31 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  47.31 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  44.71 
 
 		 87 aa  87  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  46.24 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  46.24 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  48.81 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  50.67 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 127 aa  83.6  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  54.22 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  45.83 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  50.53 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  50.56 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  45.16 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  45.16 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  50.55 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  45.56 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>