More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0920 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  100 
 
 		 98 aa  199  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  93.88 
 
 		 98 aa  189  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  93.88 
 
 		 98 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  93.88 
 
 		 98 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  93.88 
 
 		 98 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  93.88 
 
 		 98 aa  189  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  93.88 
 
 		 98 aa  189  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  93.88 
 
 		 98 aa  189  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  93.88 
 
 		 98 aa  189  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  93.88 
 
 		 98 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  93.81 
 
 		 104 aa  186  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  90.82 
 
 		 98 aa  184  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  91.84 
 
 		 98 aa  185  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  90.82 
 
 		 98 aa  184  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  90.82 
 
 		 98 aa  181  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  86.73 
 
 		 98 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  68.04 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  67.01 
 
 		 100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  65.98 
 
 		 101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  68.29 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  55.79 
 
 		 97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  56.32 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  48.96 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  51.55 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  51.55 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  55.06 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  47.31 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  50.52 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  48.91 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  48.45 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  48.45 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 99 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  47.83 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  44.32 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  46.39 
 
 		 102 aa  88.6  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  46.74 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0149  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  39.18 
 
 		 135 aa  87  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.39 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  42.39 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0923  transcriptional regulator, TrmB  46.15 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  50.56 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  43.16 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  43.3 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 99 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  44.68 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3556  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.859788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>