More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1569 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  100 
 
 		 114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  70.87 
 
 		 114 aa  149  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  72 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  65.35 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  75 
 
 		 116 aa  144  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  70.41 
 
 		 107 aa  136  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  73.12 
 
 		 107 aa  135  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  68.13 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  52.69 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  44.76 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  54.22 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  43.75 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 115 aa  91.7  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  46.32 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  49.5 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  43.01 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  46.81 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  42.99 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  53.19 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  51.25 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  46.51 
 
 		 227 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.5 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  39.36 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  42.57 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  40.43 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  54.29 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  42.39 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  54.29 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  45.88 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  42.27 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  34.65 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  41.24 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  41.24 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  41.24 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  36.73 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>