More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2570 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 116 aa  229  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  69 
 
 		 110 aa  137  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  61.32 
 
 		 109 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  61.39 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  59.8 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  58 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  56.31 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  58.59 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  59.05 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  53.51 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  60.82 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  58.95 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  61.29 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  67.09 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  52.48 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  53.77 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  53.85 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  44.95 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  52.22 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  46.46 
 
 		 117 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 		 113 aa  97.1  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  54.02 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  47.62 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  46.88 
 
 		 227 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 111 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  55.13 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  43.88 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  43.93 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 122 aa  91.3  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  47.42 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  46.59 
 
 		 97 aa  90.5  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  48.72 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  40.62 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  40.82 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  48.84 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  45.98 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  48.84 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  39.18 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  45.19 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  46.46 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  43.27 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  40.21 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  48.28 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.18 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  42.86 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.18 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  37.37 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>