More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0210 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  100 
 
 		 85 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  80.25 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  76.83 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  72.84 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  67.47 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  67.47 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  67.47 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  67.47 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  67.47 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  67.47 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  67.47 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  67.47 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  67.47 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  67.47 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  68.29 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  67.07 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 104 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  66.27 
 
 		 98 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  66.27 
 
 		 98 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  66.27 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  61.45 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  61.25 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  61.25 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  58.75 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  58.75 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  58.75 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  58.75 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  57.5 
 
 		 102 aa  91.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  48.78 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  55 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  51.22 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  53.95 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  46.99 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0149  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  55.56 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  48.78 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  48.15 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  51.22 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0923  transcriptional regulator, TrmB  48.72 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  43.37 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  48.19 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  48.15 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  47.56 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  42.68 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2472  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3741  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  45.12 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  45.12 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  45.68 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  40.48 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  42.17 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  42.68 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  45.78 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>